Il contratto di collaborazione coordinata e continuativa (Co.Co.Co.) presenta alcuni svantaggi importanti da considerare. Primo, il lavoratore con contratto Co.Co.Co. non ha piena autonomia, dovendo rispettare le esigenze aziendali senza essere un dipendente vero e proprio. Secondo, non è previsto un preavviso obbligatorio di licenziamento, perciò il rapporto può terminare all'improvviso, anche se spesso si inserisce una clausola di preavviso di 1-2 mesi. Terzo, manca un quadro normativo di riferimento chiaro perché spesso non esiste un contratto collettivo nazionale per queste forme di collaborazione. Quarto, non si ha diritto alla tredicesima mensilità, pagamento che invece spetta ai lavoratori dipendenti. Infine, l'orario di lavoro è autonomo, ma il compenso è fisso e non viene aumentato per straordinari, quindi può essere un limite se i tempi di lavoro sono lunghi. Inoltre, il Co.Co.Co. offre minori tutele rispetto al contratto subordinato, come assenza di ferie pagate, malattia e maternità con le stesse regole. C’è anche il rischio che, se il rapporto di lavoro appare più simile a un subordinato, possa essere contestato e convertito in rapporto di lavoro dipendente, con obblighi contributivi arretrati per il datore. Questi svantaggi riguardano sia il collaboratore che il committente, con implicazioni sia economiche sia di tutela del lavoratore.