Hugues Aufray habite actuellement à Marly-le-Roi, près de Versailles, dans l'ancienne demeure du sculpteur Aristide Maillol, dont il a hérité de l'atelier. Il y vit avec sa compagne Murielle, dans une maison artistique chargée d'histoire, après avoir vécu pendant 45 ans à Marnes-la-Coquette. Il possède aussi une ferme familiale en Ardèche à Orgnac-l'Aven, propriété qu'il conserve mais habitée par sa fille Marie et transformée en maison d'hôtes.