Los colores de la bandera Whipala tienen significados profundamente simbólicos vinculados con la cosmovisión andina y representan diferentes aspectos del mundo físico, espiritual y social. Cada uno de los siete colores simboliza lo siguiente:

• Rojo: representa al planeta Tierra, la Pachamama (Madre Tierra), el desarrollo cultural e intelectual, la raíz ancestral y la identidad.
• Naranja: simboliza la sociedad, la cultura, la memoria oral, la salud, la medicina ancestral y la juventud dinámica.
• Amarillo: es la energía, la fuerza, la hermandad indígena, la solidaridad, y las virtudes ancestrales como el amor, la sabiduría, el trabajo y la creatividad.
• Blanco: hace referencia al tiempo, la transformación, el avance de la ciencia y la tecnología, el arte, el trabajo intelectual y manual.
• Verde: representa la economía, la producción agrícola, la riqueza natural, la flora y fauna, y el territorio.
• Azul: simboliza el espacio cósmico, el Sistema Solar, la energía cósmica, el infinito y la organización política, económica y cultural.
• Violeta: significa la armonía, la ideología, la política, la comunidad y el poder armónico de los Andes.

La Whipala es un emblema ancestral usado por pueblos andinos, especialmente en Bolivia, y representa la unión, la cultura y la cosmovisión de los pueblos originarios de la región.